Genetic variants regulate expression of SMIM1 and the Vel blood group antigen. Extensive genotyping of blood groups Duffy Kidd and AB0 by next generation sequencing. Obok czsto stosowanych protokow typu home-made, opartych na idealnych metodach biologii molekularnej, oraz zaawansowanych metody i testw ze znakiem informacje dla wyrobw medycznych do diagnostyki in-vitro (IVD, in vitro diagnostic device directive) do typowania antygenw grup krwi, jest szybka implementacja najnowszej technologii sekwencjonowania nastpnej generacji (NGS, next generation sequencing) do poszukiwa polimorfizmw, ktre maj podoe swoistoci antygenowych. 1. Avent N.D., Madgett TE., Halawani A.J., Altayar M.A., Kiernan M., Reynolds TJ. Next generation sequencing: academic overkill or high-resolution blood group genotyping? 2.rozprawka , Halawani A.J., Kiernan M. i wsp. 10. van der Schoot C.E., Ait Soussan A., Beckers E. i wsp. 12. Belsito A., Costa D., Fiorito C. De lorio G., Grimaldi V, Napoli C. Erytrocyte genotyping with HEA Bead Chip Kit: our experience at Azienda Ospedaliera Universitaria, Second university of Naples. W zestawieniu badacze podkrelili, e rozbienoci wynikw genotypowania allelu JK otrzymane technik HEA BeadChip i fenotypowania antygenw Jka i Jkb s bardzo eleganckie (7/60 000), co zapewnia wysokiej wiarygodnoci stosowania metod molekularnych w determinacji antygenw spord tego ukadu.

Badacze wykryli siedem niezgodnoci midzy genotypem i uwaanym fenotypem a oznaczeniami serologicznymi - dwa pod wzgldem okrelenia obecnoci antygenu Jka i pi dotyczcych antygenu Jkb. 02.988A.1095C o obnionej ekspresji antygenu Jkb. A weak kodujcego warianty antygenu Jk(a) o osabionej ekspresji. W sesji plakatowej take zaprezentowano szereg doniesie o wykryciu nowych alleli kodujcych warianty przedstawiajce si osabionym fenotypem lub nieulegajce ekspresji, ktre znaleziono metodami analizy DNA.kartkwkaserologicznymi takie okazy s okrelane jako Jk(a-). Wyniki oznaczenia antygenw RhC, E i Kell obiema metodami wykazay jeden wynik rozbieny w czci dawcw i a 27/50 w liczbie pacjentw. Podsumowujc, mona okreli jak ogromne zainteresowanie metodami genotypowania antygenw krwinki czerwonej i yjca dostpno platform oraz technologii do poszukiwa o wielkiej przepustowoci miesza si na rozwj zgody na problem bogactwa podoa molekularnego rnych swoistoci antygenowych. Na XXXIII wiatowym zjedzie w Seulu, w Korei Poudniowej, zastosowanie technologii analizy kwasu deoksyrybonukleinowego (DNA, deoxyribonucleic acid) w badaniach antygenw krwinek morzach i pytkowych omawiano na sesjach Genotypowanie Grup Krwi (Blood Group Genotyping), Biaka Bonowe Krwinki Czerwonej (Red Cell Membrane Proteins), Genotypowanie grup krwi: nowy zwolennik w laboratorium (Blood genotyping: a new ally in your lab) natomiast na konferencji satelitarnej przygotowanej przez firm Grifols.

Obecnie analiza DNA do bada antygenw krwinek czy si przede wszystkim na typowaniu wielokrotnych dawcw krwi w punktu wynajdywania kobiet z nielicznymi antygenami lub genotypami stojcymi z prost czstoci, a te w jeszcze szerszym stopniu badania staj si powszechne w nawizaniu do pacjentw wymagajcych wielokrotnych transfuzji. Dodatkowo przeprowadzone badania caych sekwencji genw przekazuj wiedzy o byciu wzorw mutacji polimorficznych w tamtych regionach alleli kodujcych antygeny grup krwi, a znaczenie wykrywanych sprze w nawizaniu do dziaa immunologicznych stoi si kolejnym wyzwaniem dla badaczy. Zaznaczy, e przy wyborze technologii i zakresu genotypowania naley zapisywa si lokalnymi sprawami i uwarunkowaniami oraz opracowa plan genotypowania dawcw w nawizaniu do ofercie finansowych danego orodka, szczeglnie przy poszukiwaniu cech rzadkich, gdy pytania dotycz duych liczebnie grup. Jak obecnie jeste w zakrcie, w pochyleniu, zapomnij o zwalnianiu czy - o zgrozo! Rnica pomidzy tymi wiedzami przejawia si wtedy, gdy dbamy o powody akceptacji bd odrzucenia danej koncepcji.

Badacze podkrelili du czstotliwo wystpowania rnicy midzy technikami genotypowania a fenotypowania i potrzeb opracowania algorytmu wczenia bada genotypu antygenu Fya/Fyb jako koniecznego uzupenienia oznacze serologicznych. Na wykonanie prelegent podkreli, e z jakiej strony obecnie stosowane s w szerocy skomputeryzowane podstawy do genotypowania grup krwi o wysokiej przepustowoci, z pozostaej i uzupenianie podstaw danych wci dokonuje si rcznie przez operatora, gdy brakuje rozwiza pozwalajcych przepyw relacji midzy wykorzystywanymi platformami i systemami szpitalnymi czy laboratoryjnymi. Po przesaniu odpowiedzi zostan wystawione oceny (albo nie, skoro nie wszyscy odzywaj si do mnie). Novel alleles at the Kell blood group locus that lead to Kell variant phenotype. Duffy blood group typing: is genotyping more accurate than phenotype for Duffy Blood grouping? Pene zsekwencjonowanie alleli kodujcych antygeny z planu Duffy wykazao obecno dwch kolejnych miejsc polimorficznych w eksonie drugim (obok kodujcych antygen Fya i Fyb) i czterech we kontekstach intronowych genu. Badacze opracowali drugie etapy sekwencjonowania antygenw z systemw Rh, Duffy i Kidd: przygotowanie biblioteki przez amplifikacj cakowitej sekwencji genomowej alleli kodujcych swoistoci antygenowe z zastosowaniem reakcji acuchowej polimerazy o wysokim rozmiarze (long-range PCR, long-rangepolymerase chain reaction), ich fragmentacj i ligacj z oligonukleotydami adaptorowymi, zawierajcymi sekwencje kodu z identyfikatorem, a po sekwencjonowanie mieszaniny 70 prbek na raz.